肝癌被稱為“癌中之王”
(相關(guān)資料圖)
我國每年約有50萬人死于肝癌
世界上肝癌50%的發(fā)病率
和55%的死亡率都在中國
治療癌癥,可以直接針對癌細(xì)胞下手
如手術(shù)切除、放射治療、化療、靶向治療等
也可以整治癌細(xì)胞所賴以生存的“微環(huán)境”
即通過免疫調(diào)節(jié)
激發(fā)免疫系統(tǒng)的潛力來對抗癌癥
就在昨天,北大團(tuán)隊(duì)在Nature發(fā)表文章
首次報(bào)道了肝癌 “免疫微環(huán)境”的5種亞型
并就其中一種類型深入研究
揭示出了部分中性粒細(xì)胞
在癌癥免疫中的負(fù)面作用
為肝癌治療、乃至癌癥治療帶來新希望
2022 年11月9日,北京大學(xué)第一醫(yī)院腫瘤轉(zhuǎn)化研究中心張寧團(tuán)隊(duì)與北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心(BIOPIC)張澤民團(tuán)隊(duì)、北京大學(xué)人民醫(yī)院肝膽外科朱繼業(yè)團(tuán) 隊(duì)緊密合作,在Nature發(fā)表了題為“Liver tumor immune microenvironment subtypes and neutrophil heterogeneity”的研究論文。
該 研究首次在單細(xì)胞精度定義了肝癌的五種免疫微環(huán)境亞型(TIMELASER),探究了其細(xì)胞組成、空間分布、基因組特征和趨化因子受體-配體網(wǎng)絡(luò),首次全 面揭示腫瘤相關(guān)中性粒細(xì)胞(TAN)的異質(zhì)性,發(fā)現(xiàn)并驗(yàn)證CCL4+、PD-L1+ TAN兩個(gè)關(guān)鍵亞群的促腫瘤機(jī)制,最終通過構(gòu)建小鼠肝癌模型,從In vitro,Ex vivo,In vivo三個(gè)層面,逐步深入地證明靶向腫瘤相關(guān)中性粒細(xì)胞有望形成新的肝癌免疫治療方案,這些成果為肝癌的基礎(chǔ)研究和臨床診療提供了關(guān)鍵信息。
圖1 本研究的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
劃分
肝癌“免疫微環(huán)境”的五種亞型
每名患者的癌癥細(xì)胞所處的免疫微環(huán)境都存在差異,要想實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的免疫調(diào)節(jié)治療,就要弄清楚癌癥的免疫微環(huán)境可以分成幾種類型。因此,腫瘤的免疫微環(huán)境研究是個(gè)很重要的研究方向,不過在單細(xì)胞層面上,此前還沒有人進(jìn)行該精度的測序研究、染色研究等。
北 大團(tuán)隊(duì)根據(jù)免疫細(xì)胞的狀態(tài),首次在單細(xì)胞層面的精度上,總結(jié)提出五種免疫微環(huán)境,分別是:免疫激活型、髓系富集免疫抑制型、基質(zhì)富集免疫抑制型、免疫排斥 型和免疫駐留型。其中,第二種和第三種微環(huán)境同為免疫抑制型,但發(fā)揮作用的免疫細(xì)胞分別為髓系細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞。該環(huán)境會抑制、阻止免疫細(xì)胞正常工作,使得 免疫細(xì)胞無法吞噬殺死癌細(xì)胞,讓癌細(xì)胞在我們體內(nèi)“為所欲為”。
所以,針對免疫抑制型環(huán)境,我們需要進(jìn)一步探究,是什么讓我們的免疫細(xì)胞“罷工”了呢?團(tuán)隊(duì)針對第二種髓系富集免疫抑制型微環(huán)境進(jìn)行深入探究,發(fā)現(xiàn)原來是具有一定免疫功能的中性粒細(xì)胞發(fā)生了“叛變”。
圖2 腫瘤免疫微環(huán)境的5種亞型(TIMELASER)示意圖
百萬細(xì)胞數(shù)據(jù)
揭示中性粒細(xì)胞的“叛變”
什么是中性粒細(xì)胞?中性粒細(xì)胞是人體最豐富的粒細(xì)胞類型,占人體所有白細(xì)胞的40%至70%,具備強(qiáng)大的吞噬能力,是宿主抵抗入侵病原體的第一道防線,是實(shí)打?qū)嵉暮眉?xì)胞、戰(zhàn)斗士。按理說,它應(yīng)該幫著免疫細(xì)胞一起吞噬殺滅入侵的癌細(xì)胞,就像此前的觀點(diǎn)一直認(rèn)為的那樣。
但是,本次實(shí)驗(yàn)分析了3萬多個(gè)中性粒細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)有些中性粒細(xì)胞在癌細(xì)胞周圍不僅不好好進(jìn)攻,反而“策反”免疫細(xì)胞加入“罷工”行列,眼睜睜地看著癌細(xì)胞生長。找到這個(gè)原因,就提供了一個(gè)新的改善免疫微環(huán)境的方向,也就是今后肝癌治療的新方向。
那 么,為什么此前都未發(fā)現(xiàn)中性粒細(xì)胞在免疫微環(huán)境中發(fā)生了“叛變”呢?首先,這是因?yàn)橹行粤<?xì)胞在微環(huán)境中的含量較少,如果不進(jìn)行單細(xì)胞精度的觀察,極容易 忽略。第二,還因?yàn)橹行粤<?xì)胞是一類非常脆弱的細(xì)胞,通常認(rèn)為其在體內(nèi)進(jìn)入外周血(即骨髓以外的血液)后存活不超過一周,體外存活不超過24小時(shí)。所以, 提取和保存難度很大。
本 次實(shí)驗(yàn)對中性粒細(xì)胞的成功分析,其一得益于“無抗體富集”策略,即全盤研究細(xì)胞的策略。對研究團(tuán)隊(duì)來說,這是一個(gè)“大膽的決定”。因?yàn)橄胍鰺o偏差的研究 就要把所有的細(xì)胞都仔細(xì)分析。團(tuán)隊(duì)拿到了100多萬個(gè)細(xì)胞,其中的數(shù)據(jù)處理比普通的幾萬個(gè)細(xì)胞的難度要上很大的層級,為了實(shí)現(xiàn)最優(yōu)的分析結(jié)果,數(shù)據(jù)分析方 案經(jīng)過了多次優(yōu)化和推倒重來。
研 究中遇到最大的困難就是細(xì)胞分群。當(dāng)團(tuán)隊(duì)拿到100多萬個(gè)數(shù)據(jù)后,要判斷出每一個(gè)細(xì)胞的類屬。判斷的依據(jù)在于細(xì)胞的基因,而每一個(gè)細(xì)胞里邊平均約有 2000多個(gè)基因。同時(shí)細(xì)胞分群要跟已發(fā)表數(shù)據(jù)緊密結(jié)合,既要閱讀大量文獻(xiàn),確定已經(jīng)報(bào)道的細(xì)胞類群,又要對多個(gè)全新的細(xì)胞亞群進(jìn)行首次定義。因此,一定 要非常嚴(yán)謹(jǐn)和細(xì)致。經(jīng)過一年多的前期數(shù)據(jù)分析,團(tuán)隊(duì)才把這100多萬個(gè)細(xì)胞的類別定出來。
圖3 中性粒細(xì)胞亞群的組織分布、發(fā)育軌跡和癌種富集
最終,團(tuán)隊(duì)得到了涵蓋了13個(gè)大類的89個(gè)小亞群,文章中首次發(fā)現(xiàn)了之前未報(bào)道的11種中性粒細(xì)胞。這次分出的89個(gè)亞群,也為今后癌癥的精準(zhǔn)治療提供了分子遺傳學(xué)的基礎(chǔ),不僅是對肝癌,對所有的癌癥來說,都很有意義。
走在世界前列:
“細(xì)胞等不了,熬夜是常態(tài)”
“我 們這個(gè)工作能夠走在世界前列,除了在實(shí)驗(yàn)方法的進(jìn)步以外,還因?yàn)槲覀儗?shí)驗(yàn)和臨床有非常好的配合。”張寧教授回憶團(tuán)隊(duì)進(jìn)行科研攻關(guān)時(shí)的密切配合感慨道,“因 為我們的細(xì)胞要根據(jù)病人做手術(shù)的需要來,所以我們和臨床配合得非常緊密。晚上八九點(diǎn)鐘了,薛老師他們就在手術(shù)房外等著,臨床組的樣本一下來,實(shí)驗(yàn)組馬上就 去分細(xì)胞,一直分到夜里十一二點(diǎn)鐘那都是常有的,熬夜也是常態(tài)。因?yàn)檫@個(gè)細(xì)胞是等不了的,只要三個(gè)小時(shí)之后,細(xì)胞就見不著了。要做100多個(gè)人,100多 萬個(gè)細(xì)胞,這樣的一個(gè)龐大的數(shù)據(jù)樣本,那是要有奉獻(xiàn)精神的。這就是我們北大的優(yōu)勢,北大各個(gè)學(xué)科都很強(qiáng)、都很齊,同時(shí)我們的老師們有奉獻(xiàn)精神,這是我印象 很深的?!?/p>
本 次實(shí)驗(yàn)由來自北京大學(xué)第一醫(yī)院的張寧教授課題組、北京大學(xué)BIOPIC(生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心)的張澤民教授課題組和北京大學(xué)人民醫(yī)院的朱繼業(yè)教授課題組 聯(lián)合完成。張寧教授課題組牽頭提出思路想法并進(jìn)行實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)與操作,朱繼業(yè)教授課題組提供臨床樣本,張澤民教授課題組提供生物信息分析技術(shù)。這樣三個(gè)課題 組,體現(xiàn)了現(xiàn)代科學(xué)研究的特點(diǎn):一個(gè)大的科學(xué)問題需要多個(gè)團(tuán)隊(duì)合作完成,而北大則恰好提供了優(yōu)勢合作的平臺。
為今后肝癌乃至癌癥治療
提供關(guān)鍵入口
本 次研究的另一大創(chuàng)新處在于,課題組在數(shù)據(jù)分析與動物驗(yàn)證方面結(jié)合得非常好。張寧介紹文章受到了學(xué)術(shù)界很多關(guān)注:“我們把醫(yī)療出來的病例進(jìn)行數(shù)據(jù)分析之后, 還通過動物實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證,數(shù)據(jù)分析的結(jié)果和動物實(shí)驗(yàn)的匹配達(dá)成了非常好的契合?!边@更加強(qiáng)有力地說明了研究的準(zhǔn)確性和科學(xué)性。
圖4 Anti-Ly6G抗體去除中性粒細(xì)胞可以有效緩解小鼠肝癌生長
根據(jù)實(shí)驗(yàn)得出的確鑿數(shù)據(jù),團(tuán)隊(duì)提出,中性粒細(xì)胞可以是肝癌甚至是癌癥治療中的一個(gè)重要靶點(diǎn)。這就為了今后肝癌乃至癌癥治療提供了一個(gè)非常重要且關(guān)鍵的入口,在此基礎(chǔ)上進(jìn)行研究和突破,關(guān)于肝癌會有更好的治療方法和診斷方法。
附: 薛瑞棟(北京大學(xué)第一醫(yī)院)、張啟明(北京大學(xué)BIOPIC)、曹奇(北京大學(xué)第一醫(yī)院)、孔瑞瑞(北京大學(xué)第一醫(yī)院)和向驍(北京大學(xué)人民醫(yī)院)是該論 文的并列第一作者。張寧(北京大學(xué)第一醫(yī)院腫瘤轉(zhuǎn)化中心)、張澤民(北京大學(xué)BIOPIC)和朱繼業(yè)(北京大學(xué)人民醫(yī)院)為共同通訊作者。該研究得到國家 自然基金、“十三五”國家科技重大專項(xiàng)、國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、基礎(chǔ)科學(xué)中心等多項(xiàng)國家科學(xué)基金的支持和資助。
來源 北京大學(xué)
編輯 孟紫薇
流程編輯 劉偉利
關(guān)鍵詞: 中性粒細(xì)胞 免疫細(xì)胞 北京大學(xué)第一醫(yī)院 癌癥治療